| 5区 | (5km) | None | None |
|---|---|---|---|
| 順位 | 走者 | チーム名 | 区間タイム |
| 1 | 大野 成輝(2) | 東京工業大学 | 0:15:34 |
| 1 | 靍見 健太（2） | 横浜国立大学 | 0:15:34 |
| 3 | 渡邊 真大(1) | 新潟大学 | 0:15:47 |
| 3 | 篠原 理玖(4) | 静岡大学 | 0:15:47 |
| 5 | 田沼 怜(M1) | 東北大学 | 0:15:48 |
| 6 | 落合 亮太(3) | 信州大学 | 0:15:54 |
| 7 | 金川 亮太(3) | 一橋大学 | 0:15:55 |
| 8 | 出淵 文也(3) | 高崎経済大学 | 0:16:02 |
| 9 | 阿部 拓巳（4） | 千葉大学 | 0:16:07 |
| 10 | 吉川 絢斗（2） | 東京学芸大学 | 0:16:12 |
| 11 | 利根川 輝(1) | 福島大学 | 0:16:16 |
| 11 | 西口 翔太(2) | 埼玉大学 | 0:16:16 |
| 13 | 遠藤 洋平(2) | 群馬大学 | 0:16:19 |
| 14 | 内藤 海音(3) | 東京外国語大学 | 0:16:34 |
| 15 | 髙野 太陽(3) | 山梨大学 | 0:16:44 |
| 16 | 松本 勇生(3) | 東京都立大学 | 0:17:01 |
| 17 | 中村 天嶺(2) | 茨城大学 | 0:17:29 |
| 18 | 増田 知大（3） | 宇都宮大学 | 0:18:09 |
| 19 | 佐藤 洸太(2) | 電気通信大学 | 0:18:24 |
| 20 | 村上 晃太(1) | 東京農工大学 | 0:18:49 |