| 2区 | (3.12km) | None | None |
|---|---|---|---|
| 順位 | 走者 | チーム名 | 区間タイム |
| 1 | 羽鳥 紘文(1) | 新潟大学 | 0:09:24 |
| 2 | 梅村 一輝(M2) | 横浜国立大学 | 0:09:30 |
| 3 | 清﨑 佑(4) | 一橋大学 | 0:09:37 |
| 4 | 中村 駿吾(4) | 信州大学 | 0:09:41 |
| 5 | 室井 颯人(4) | 群馬大学 | 0:09:43 |
| 5 | 牧野 雅紘(4) | 東北大学 | 0:09:43 |
| 7 | 三村 将太(2) | 東京工業大学 | 0:09:44 |
| 8 | 滝沢 亮(1) | 東京都立大学 | 0:09:51 |
| 9 | 生方 利樹(4) | 高崎経済大学 | 0:09:54 |
| 10 | 栗山 樹希(1) | 静岡大学 | 0:10:06 |
| 11 | 谷中田 健太(4) | 福島大学 | 0:10:07 |
| 11 | 中村 文哉（3） | 東京学芸大学 | 0:10:07 |
| 13 | 木下 直樹（4） | 宇都宮大学 | 0:10:15 |
| 14 | 北原 廉(M2) | 電気通信大学 | 0:10:16 |
| 15 | 鬼澤 大地(2) | 茨城大学 | 0:10:22 |
| 16 | 金澤 宏哉(1) | 埼玉大学 | 0:10:40 |
| 17 | 伊藤 快太（2） | 千葉大学 | 0:10:50 |
| 18 | 内田 壮太(4) | 山梨大学 | 0:11:10 |
| 19 | 下野 雄大(M1) | 東京外国語大学 | 0:11:13 |
| 20 | 岩永 匠生(3) | 東京農工大学 | 0:13:10 |